Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnga4Q3UW12 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnga4Q3UW12 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms