Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slfn4Q3UV66 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms