Protein–RNA interactions for Protein: Q3USH1

Fam196a, Protein FAM196A, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam196aQ3USH1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fam196aQ3USH1 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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