Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR50

Vwa5b2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b2Q3UR50 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vwa5b2Q3UR50 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vwa5b2Q3UR50 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms