Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Skap2Q3UND0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Skap2Q3UND0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms