Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Hdgfl2Q3UMU9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms