Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sf3b2Q3UJB0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sf3b2Q3UJB0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms