Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc34Q3UI66 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc34Q3UI66 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms