Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atxn7l3bQ3UD01 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atxn7l3bQ3UD01 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms