Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm45175-201ENSMUST00000208295 1375 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29747-201ENSMUST00000194764 585 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Gtpbp6Q3U6U5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms