Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sec24aQ3U2P1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sec24aQ3U2P1 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms