Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fam193bQ3U2K0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fam193bQ3U2K0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms