Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pag1Q3U1F9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms