Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Lrrn4clQ3TYX2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms