Protein–RNA interactions for Protein: Q3TT99

Gdpd4, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd4Q3TT99 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gdpd4Q3TT99 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gdpd4Q3TT99 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms