Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNA1

Xylb, Xylulose kinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XylbQ3TNA1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
XylbQ3TNA1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms