Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Smarca4Q3TKT4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Smarca4Q3TKT4 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms