Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC33

Ccdc127, Coiled-coil domain-containing protein 127, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc127Q3TC33 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc127Q3TC33 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ccdc127Q3TC33 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms