Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trpm1Q2TV84 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trpm1Q2TV84 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms