Protein–RNA interactions for Protein: Q2MDG0

Rhox4d, Reproductive homeobox 4D, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox4dQ2MDG0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rhox4dQ2MDG0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rhox4dQ2MDG0 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rhox4dQ2MDG0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rhox4dQ2MDG0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms