Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fam178bQ24JP3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Fam178bQ24JP3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fam178bQ24JP3 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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