Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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Shroom4Q1W617 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Shroom4Q1W617 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
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Shroom4Q1W617 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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Shroom4Q1W617 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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Shroom4Q1W617 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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Shroom4Q1W617 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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Shroom4Q1W617 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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Shroom4Q1W617 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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Shroom4Q1W617 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
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Shroom4Q1W617 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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Shroom4Q1W617 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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Shroom4Q1W617 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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Shroom4Q1W617 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
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Shroom4Q1W617 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Shroom4Q1W617 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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