Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Samd11Q1RNF8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Samd11Q1RNF8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms