Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cpne9Q1RLL3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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