Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ptcd3Q14C51 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptcd3Q14C51 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptcd3Q14C51 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptcd3Q14C51 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptcd3Q14C51 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ptcd3Q14C51 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.1 ms