Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ptchd1Q14B62 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ptchd1Q14B62 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ptchd1Q14B62 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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ptchd1Q14B62 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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ptchd1Q14B62 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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ptchd1Q14B62 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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ptchd1Q14B62 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ptchd1Q14B62 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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ptchd1Q14B62 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ptchd1Q14B62 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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