Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttc21bQ0HA38 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms