Protein–RNA interactions for Protein: Q07646

Mest, Mesoderm-specific transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MestQ07646 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MestQ07646 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
MestQ07646 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
MestQ07646 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
MestQ07646 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MestQ07646 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
MestQ07646 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
MestQ07646 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MestQ07646 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
MestQ07646 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MestQ07646 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MestQ07646 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
MestQ07646 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
MestQ07646 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms