Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Col17a1Q07563 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Col17a1Q07563 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms