Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.64■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Cntn3Q07409 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cntn3Q07409 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms