Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Sh3bp2Q06649 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sh3bp2Q06649 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms