Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Atf4Q06507 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms