Protein–RNA interactions for Protein: Q05722

Col9a1, Collagen alpha-1(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a1Q05722 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Col9a1Q05722 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms