Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Apoc2Q05020 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms