Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Sox9Q04887 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox9Q04887 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms