Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Smarcad1Q04692 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Smarcad1Q04692 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms