Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Smpd1Q04519 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms