Protein–RNA interactions for Protein: Q03719

Kcnd1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnd1Q03719 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kcnd1Q03719 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms