Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Scg2Q03517 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Scg2Q03517 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms