Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NfiaQ02780 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NfiaQ02780 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms