Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gjb4Q02738 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gjb4Q02738 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms