Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Muc1Q02496 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Muc1Q02496 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Muc1Q02496 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Muc1Q02496 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Muc1Q02496 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Muc1Q02496 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Muc1Q02496 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms