Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ascl1Q02067 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ascl1Q02067 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms