Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Uba1Q02053 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms