Protein–RNA interactions for Protein: Q01727

Mc1r, Melanocyte-stimulating hormone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mc1rQ01727 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mc1rQ01727 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms