Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sec23aQ01405 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sec23aQ01405 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms