Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top2aQ01320 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top2aQ01320 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms