Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Grin2cQ01098 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Grin2cQ01098 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms