Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Pde1bQ01065 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms