Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gjb2Q00977 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gjb2Q00977 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms